82. Syntetické bunky III: Môžeme postaviť bunky od základov?

/in , /by

“Čo nedokážem postaviť, tomu nerozumiem,” povedal Richard Feynman. V tejto epizóde sa teda budeme rozprávať o stavbe syntetických buniek od základov, o výzvach, ktorým pri tomto prístupe čelíme a o nebunkovej (“cell-free”) biológii.

Referencie:

[1] Berhanu, S., Ueda, T., & Kuruma, Y. (2019). Artificial photosynthetic cell producing energy for protein synthesis. Nature Communications, 10(1), 1325. https://doi.org/10.1038/s41467-019-09147-4

[2] Adamala, K. P., Martin-Alarcon, D. A., Guthrie-Honea, K. R., & Boyden, E. S. (2017). Engineering genetic circuit interactions within and between synthetic minimal cells. Nature Chemistry, 9(5), 431–439. https://doi.org/10.1038/nchem.2644

[3] Powell, K. (2018). How biologists are creating life-like cells from scratch. Nature, 563(7730), 172–175. https://doi.org/10.1038/d41586-018-07289-x

[4] Elani, Y., Trantidou, T., Wylie, D., Dekker, L., Polizzi, K., Law, R. V., & Ces, O. (2018). Constructing vesicle-based artificial cells with embedded living cells as organelle-like modules. Scientific Reports, 8(1), 4564. https://doi.org/10.1038/s41598-018-22263-3

Súvisiace dávky: 

PD #78: O najmenšej syntetickej bunke
PD #74: Úvod do témy syntetických buniek

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka!) na SK1283605207004206791985. Ďakujeme! Viac info o podpore na pravidelnadavka.sk/#chcem-podporit

78. Syntetické bunky II: ako vznikla najmenšia syntetická bunka

/in , /by

Existujú dva prístupy k stavbe syntetických buniek. Dnes si predstavíme “top-down” prístup k stavbe syntetických buniek, fascinujúce výsledky vedcov z J Craig Venter Institute, najmenší syntetický organizmus JCVI-syn3.0 a dôjde aj na esenciálne gény!

Referencie a odporúčaná literatúra

[1] Hutchison III, C. A., Chuang, R.-Y., Noskov, V. N., Assad-Garcia, N., Deerinck, T. J., Ellisman, M. H., … Venter, J. C. (n.d.). Design and synthesis of a minimal bacterial genome. https://doi.org/10.1126/science.aad6253

 [2] Glass, J. I., Merryman, C., Wise, K. S., Hutchison, C. A., & Smith, H. O. (2017). Minimal Cells—Real and Imagined. Cold Spring Harbor Perspectives in Biology, 9(12), a023861. https://doi.org/10.1101/cshperspect.a023861

[3] Göpfrich, K., Platzman, I., & Spatz, J. P. (2018). Mastering Complexity: Towards Bottom-up Construction of Multifunctional Eukaryotic Synthetic Cells. Trends in Biotechnology, 36(9), 938–951. https://doi.org/10.1016/J.TIBTECH.2018.03.008

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka!) na SK1283605207004206791985. Ďakujeme! Viac info o podpore na pravidelnadavka.sk/#chcem-podporit

74. Syntetické bunky: najambicióznejší projekt v histórii

/in , /by

Život je často ťažký, a to nielen ten náš osobný ale aj ten biologický. V dnešnej dávke, nahranej v americkom MIT, si povieme aj o nasledovnom: čo je to život, prečo nie je jednoduché definovať, a či vedci vedia už stvoriť život.

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka!) na SK1283605207004206791985. Ďakujeme! Viac info o podpore na pravidelnadavka.sk/#chcem-podporit

70. O Ebole a jej epidémii v Kongu

/in , /by

Ebola je jednou z najnebezpečnejších infekčných chorôb s akými sa ľudstvo doteraz stretlo a v Kongu momentálne zúri jedna z jej najzávažnejších epidémií.

Prečo je Ebola taká smrteľná? Hrozí nám, že sa rozšíri po celom svete? Môže jednoducho zmutovať alebo byť zneužitá na zlovoľné účely? Prečo vypukla jej epidémia práve v Kongu? A existuje proti Ebole účinná vakcína? O tom všetkom sa porozprávame v dnešnej Pravidelnej dávke. 

Zdroje:

[1] Výborný aktuálny článok z New York Times o epidémii Eboly v Kongu.

[2] Štúdia skúmajúca účinnosť vakcíny rVZV-EBOV voči Ebole: Henao-Restrepo, A. M., Camacho, A., Longini, I. M., Watson, C. H., Edmunds, W. J., Egger, M., … Kieny, M.-P. (2017). Efficacy and effectiveness of an rVSV-vectored vaccine in preventing Ebola virus disease: final results from the Guinea ring vaccination, open-label, cluster-randomised trial (Ebola Ça Suffit!). Lancet (London, England), 389(10068), 505–518. https://doi.org/10.1016/S0140-6736(16)32621-6

[3] Základné a zrozumiteľné informácie o vakcíne proti Ebole poskytnuté Svetovou zdravotníckou organizáciou.

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka!) na SK1283605207004206791985. Ďakujeme! Viac info o podpore na pravidelnadavka.sk

66. Môže nám syntetická biológia pomáhať pri skúmaní vesmíru?

/in , /by

Zdalo by sa, že syntetická biológia a astronómia si musia byť na míle vzdialené – syntetická biológia skúma maličké bunky a astronómia sa zase venuje nedozerným vesmírnym diaľavám.  

Pri príležitosti 50. výročia pristátia misie Apollo 11 na Mesiaci sa v ďalšej Pravidelnej Dávke porozprávame o tom, ako syntetická biológia môže pomôcť astronautom pri budúcich vesmírnych misiách.

Použitá a odporúčaná literatúra:

[1] Krátky článok o diskutovaných výzvach kozmonautiky, ktoré nám môže syntetická biológia pomôcť riešiť: https://www.nasa.gov/content/synthetic-biology

[2] Komplexný článok popisujúci možnosti a výzvy využitia syntetickej biológie vo vesmíre:  Menezes, A. A., Montague, M. G., Cumbers, J., Hogan, J. A., & Arkin, A. P. (2015). Grand challenges in space synthetic biology. J. R. Soc. Interface, 12. https://doi.org/10.1098/rsif.2015.0803

[3] Prepis podcastu s Lynn Rothschild, ktorá sa venuje astrobiológii, v ktorom možno vybadať veľmi zaujímavý spôsob uvažovania nad pôvodom života: https://www.nasa.gov/ames/nisv-podcast-Lynn-Rothschild/

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka!) na SK1283605207004206791985. Ďakujeme! Viac info o podpore na pravidelnadavka.sk

62. O vzťahu medzi baktériami v črevnom mikrobióme a atletickým výkonom

/in , /by

Črevný mikrobióm a jeho vplyv na rôzne aspekty nášho zdravia, či fyzického a psychického výkonu je jedným z najzaujímavejších objektov moderného biologického a medicínskeho výskumu.

V ďalšej časti Pravidelnej Dávky zameranej na bioinžinierstvo si povieme viac o nedávnom výskume vzťahu medzi zložením črevného mikrobiómu a výkonom elitných atlétov. Môže istý rod baktérií prispievať k lepšiemu výkonu a regenerácii u týchto športovcov? To sa dozviete v dnešnej Pravidelnej Dávke! 

Referencie:

Originálna štúdia o analýze črevného mikrobiómu a súvislosti s atletickým výkonom.

[1] Scheiman, J., Luber, J. M., Chavkin, T. A., MacDonald, T., Tung, A., Pham, L.-D., … Kostic, A. D. (2019). Meta-omics analysis of elite athletes identifies a performance-enhancing microbe that functions via lactate metabolism. Nature Medicine, 1. https://doi.org/10.1038/s41591-019-0485-4

Zaujímavá a relatívne prístupná štúdia o vplyve našej stravy na črevný mikrobióm.  

[2] Zmora, N., Suez, J., & Elinav, E. (2019). You are what you eat: diet, health and the gut microbiota. Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, 16(1), 35–56. https://doi.org/10.1038/s41575-018-0061-2

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka!) na SK1283605207004206791985. Ďakujeme! Viac info o podpore na pravidelnadavka.sk

58. Ako nám syntetická biológia pomáha bojovať proti znečisteniu životného prostredia

/in , /by

Syntetická biológia, ktorá sa venuje úprave a vytváraniu nových biologických systémov, je jednou z najfascinujúcejších inžinierskych disciplín súčasnosti. Na druhej strane, znečistenie ovzdušia  a priemyselný odpad patria medzi najväčšie výzvy pre súčasnú spoločnosť.  V dnešenej dávke sa porozprávame o tom, ako jedna firma využíva syntetickú biológiu v boji so škodlivými látkami.

Použitá a odporúčaná literatúra:

Video vysvetľujúce proces spracovania oxidu uhoľnatého v spoločnosti LanzaTech.

Štúdia o využití C. autoethanogenum  na optimalizovanú výrobu etanolu.

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka) na SK1283605207004206791985 alebo nás podporte ešte mesiac priamo cez Startlab. Ďakujeme!

54. O nových zisteniach v prípade narodenia geneticky upravených detí v Číne

/in , /by

Narodenie geneticky upravených detí bolo jednou z najzávažnejších medicínskych a vedeckých udalostí, ktoré sa udiali v posledných rokoch. Táto udalosť rozvírila množstvo diskusií nielen o technických a vedeckých, ale najmä o etických aspektoch takéhoto počinu. 

V dnešnej Pravidelnej Dávke sa stručne porozprávame o narodení geneticky upravených detí, o reakcii vedeckej komunity na tento objav a o nových zisteniach týkajúcich sa tohto prípadu.

Štúdia Dr. Nielsena z Nature Medicine o potenciálnej škodlivosti mutácie poskytujúcej odolnosť na HIV: https://www.nature.com/articles/s41591-019-0459-6

Výborná štúdia z PLoS Biology o problémoch genetického upravovania detí: https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3000224

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka) na SK1283605207004206791985 alebo nás podporte ešte mesiac priamo cez Startlab. Ďakujeme! 

Zdroj obrázka: Google Images (labeled for non-commercial reuse)

50. O génovej terapii a jej využití pri liečbe nádorov mozgu

/in , /by

Glioblastóm je jedným z najnebezpečnejších nádorov mozgu. V tejto PD sa preto budeme rozprávať o tom, čo je to génová terapia a ako môže byť využitá pri liečbe nádorov. Dozviete sa o “genetických receptoch” o tom, či je stará fráza “alkohol mu stúpol do hlavy” pravdivá a ešte omnoho viac!

Skrátenú verziu a ochutnávku tejto pravidelnej dávky si môžete prečítať aj na tomto blogu na Denníku N.

 ***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka) na SK1283605207004206791985 alebo nás podporte ešte mesiac priamo cez Startlab. Ďakujeme! 

Zdroj obrázka: Google Images (labeled for non-commercial reuse)

48. O novom začiatku Pravidelnej dávky s Andrejom a Mirom

/in , , , /by

Šepkalo sa o tom už dlhšie a dnes sa o tom už hovorí nahlas. Podcast Pravidelná dávka sa osamostatňuje (www.pravidelnadavka.sk) a rozširuje o témy vzťahu, histórie a filozofie vedy a náboženstva, a taktiež o súčasné výzvy z oblasti bioinžinierstva, syntetickej biológie či bioetiky. Spolu s Mirom a Andrejom vám prestavím víziu a hodnoty nášho nového spoločného podcastu — a našu crowdfundingovú kampaň, ktorú sme z tejto príležitosti spustili, môžete podporiť na www.startlab.sk/projekty/885-pravidelna-davka

***

Dobré veci potrebujú svoj čas. Pomohla ti táto dávka zamyslieť sa nad niečím zmysluplným? Podpor tvoj obľúbený podcast sumou 1€, 5€ alebo 10€ (trvalý príkaz je topka) na SK1283605207004206791985 alebo nás podporte ešte mesiac priamo cez Startlab. Ďakujeme!